brughagedis.nl

Als informatiespecialist moet ik af en toe met iets bezighouden wat daar mee te maken heeft. Zo werd mij gisteren gevraagd hoe ver de citaties in Web of Science (WoS) terug gaan. Wij hebben een abonnement vanaf 1988 maar het is niet zo dat verwijzingen naar artikelen van voor 1988 niet zichtbaar zijn. Ze hebben alleen geen aanklikbare link, zoals bij de records van na 1988 voor artikelen in de tijdschriften op de voorkeurslijst van WoS. Een zoekopdracht in Cited reference Search EINSTEIN A* en Publication year 1905 levert een heleboel treffers op. Maar als je een aantal ervan aanvinkt en op Complete search klikt, dan is het resultaat alleen de records van artikelen na 1988 met verwijzingen naar die artikelen uit 1905. Even op het web zoeken levert het gegeven op dat WoS tijdschriften indexeert vanaf 1900. Maar ook in 1900 waren er natuurlijk al artikelen met verwijzingen naar nog eerder verschenen publicaties. Die staan dus ook allemaal in de database. Zo vind je voor het jaar 1836 van Darwin vier records. Die blijken allemaal geciteerd te worden in artikelen na 1988. Betekent dit dat je meer treffers zou krijgen als we licentie hadden die verder teruggaat dan 1988? Ik vermoed van wel. In ieder geval vind je de twee artikelen uit 1936 van Darwin die in Darwin Online vermeld staan niet terug in onze versie van WoS.

Scopus gaat terug tot 1960. In Scopus zelf worden veel minder resulaten gevonden dan in Web of Science, maar onder het tabblad More…  wordt in de verwijzingen gezocht en kun je het publicatiejaar voor de zoekopdracht naar Darwin C uitbreiden tot 1780. Voor het jaar 1836 zijn er vijf treffers, waaronder wel de twee artikelen die in Darwin Online vermeld worden.

In beide bestanden kun je teruggaan tot het jaar 1000 en vind je nog treffers. Maar dit zijn waarschijnlijk allemaal foutieve vermeldingen van het publicatiejaar. Zo vind je in Scopus weliswaar 52 treffers, maar ik denk dat ze toen nog niet hadden gehoord van “mental disorders in primary care” en in WoS vind je er 25, maar had men oog voor ZHAO L, SUMMER MIST ALONG LA  in het jaar 1100?

Vooruitwerken kan ook, in Scopus vind je alvast 8 treffers in de References uit het jaar 3000, maar WoS vind ik niks meer na 2009.

Vanochtend werd ik door Zygomorf geattendeerd op Naturenews van 27 maart waarin een stukje staat de over snelle evolutie van de brughagedis (Tuatara). Je zou het niet verwachten van een dier dat 200 miljoen jaar onveranderd is, een langzame groeit kent (ongeveer 50 cm in 35 jaar), een trage stofwisseling heeft en waarvan de jongen pas na 10 tot 15 jaar geslachtsrijp worden. Onderzoekers uit Nieuw-Zeeland hebben echter DNA uit 8750 jaar oude botten vergeleken met DNA van nu levende soortgenoten. Door de verschillen in de volgorde van de DNA-baseparen te bepalen, kan berekend worden hoe snel het DNA sindsdien veranderd is. Bij de Tuatara worden naar schatting 1.37 – 1.56 veranderingen in basepaarvolgorde per miljoen jaar gemeten. Vergelijkende cijfers bij andere dieren komen uit op ongeveer 0.2 veranderingen in de basepaarvolgorde per miljoen jaar. Bij metingen aan fossielen van Adélie-pinguïns zijn cijfers gemeten die vergelijkbaar zijn met die van de Tuatara. Het is nog de vraag in hoeverre de cijfers gemeten aan DNA-volgorde van fossielen vergelijkbaar zijn met metingen aan nog levende soorten. Het zou kunnen dat het fossiele DNA in de tussentijd zo beschadigd is geraakt dat tot afwijkende cijfers leidt.

Figuur: Vergelijking van de evolutionare snelheden van DNA afkomstig uit mitochondriaal materiaal van de Brughagedis (Tuatara) met negen andere soorten gewervelde dieren. Van boven naar beneden: Tuatara, Adélie-pinguïn, Oeros, een uitgestorven Moa, Bison, Bruine beer, Holenbeer, Holenleeuw, Rund en Paard.
Afkomstig uit:  Trends in Genetics, Volume 24, Issue 3, Maart 2008, Bladzijde 106-109.