brughagedis.nl

Deze blog gaat over mezelf en mijn bezigheden



Category: Brughagedis

Spoetnik symposium

27 November, 2008 (09:11) | Blog's, Brughagedis, Spoetnik | By: brughagedis

Giateren werd het afsluitende Spoetnik symposium gehouden waarin o.a. Laika een erg leuke en met veel sinaasappels geïllustreerde Powerpoint-presentatie over bloggen gaf. Ook bleek dat de Spoetnik-cursus tot ver buiten de UBA aandacht heeft getrokken en hier en daar in soms ver afgeslankte vorm wordt overgenomen. Het aantal nieuwe Web 2.0 – toepassingen dat wekelijks verschijnt is enorm en het blijft nog een beetje de vraag welke daarvan bruikbaar zijn in de dagelijkse werkomgeving. Bij ons zijn inmiddels in heel bescheiden mate een aantal al wel toegepast, waaronder met name de fotoalbums en Google docs. Het open source cms phpWebSite werd door mij al voor de cursus ontdekt en gebruikt als ingang van het boeken selectie-project voor de medewerkers.  Voor mij is de cursus vooral ook een leuke speelplaats geweest waarin ik kennis kon maken  met nieuwe toepassingen  toepassingen en het bloggen in het bijzonder. Dat veel daarvan thuis en in de avonduurtjes heeft plaatsgevonden bleek een gemeenschappelijk gedeelde ervaring.

Door Robin van Schijndel werd mijn personage tijdens de inleiding ook nog even in het zonnetje gezet. Dat had totaal niet gehoeven, maar met de iMac die in een van mijn pagina’s uit elkaar wordt gehaald, gaat het inmiddels heel goed. Transplantatie van een harde schijf bleek uiteindelijk de oplossing van het probleem. Ik gebruik hem nu vooral voor muziek.

Wie ook nog wel vermeld mag worden is WoW!ter uit Wageningen, want zijn onvermoeibare hulp en uitleg heeft op een aantal cruciale momenten zeker bijgedragen aan de goede afloop. Aan het eind van de middag was er een borrel en vond ik het leuk om in persoon kennis te maken met Turquoois en eindelijk ook … Laika. 

Gerepareerde iMac 

Snelle evolutie van de Brughagedis

2 April, 2008 (08:56) | Brughagedis | By: brughagedis

Vanochtend werd ik door Zygomorf geattendeerd op Naturenews van 27 maart waarin een stukje staat de over snelle evolutie van de brughagedis (Tuatara). Je zou het niet verwachten van een dier dat 200 miljoen jaar onveranderd is, een langzame groeit kent (ongeveer 50 cm in 35 jaar), een trage stofwisseling heeft en waarvan de jongen pas na 10 tot 15 jaar geslachtsrijp worden. Onderzoekers uit Nieuw-Zeeland hebben echter DNA uit 8750 jaar oude botten vergeleken met DNA van nu levende soortgenoten. Door de verschillen in de volgorde van de DNA-baseparen te bepalen, kan berekend worden hoe snel het DNA sindsdien veranderd is. Bij de Tuatara worden naar schatting 1.37 – 1.56 veranderingen in basepaarvolgorde per miljoen jaar gemeten. Vergelijkende cijfers bij andere dieren komen uit op ongeveer 0.2 veranderingen in de basepaarvolgorde per miljoen jaar. Bij metingen aan fossielen van Adélie-pinguïns zijn cijfers gemeten die vergelijkbaar zijn met die van de Tuatara. Het is nog de vraag in hoeverre de cijfers gemeten aan DNA-volgorde van fossielen vergelijkbaar zijn met metingen aan nog levende soorten. Het zou kunnen dat het fossiele DNA in de tussentijd zo beschadigd is geraakt dat tot afwijkende cijfers leidt.

Evolutionaire snelheid vertebraten

Figuur: Vergelijking van de evolutionare snelheden van DNA afkomstig uit mitochondriaal materiaal van de Brughagedis (Tuatara) met negen andere soorten gewervelde dieren. Van boven naar beneden: Tuatara, Adélie-pinguïn, Oeros, een uitgestorven Moa, Bison, Bruine beer, Holenbeer, Holenleeuw, Rund en Paard.
Afkomstig uit: 
Trends in Genetics, Volume 24, Issue 3, Maart 2008, Bladzijde 106-109.

coComments, Wiki’s en privacy

30 March, 2008 (16:52) | Blog's, Brughagedis, Spoetnik, wordpress | By: brughagedis

Het kwartje is wat betreft de coComments eindelijk gevallen. Maar ik vind de werking enigszins haperen. Op de website worden allerlei nieuwe termen als conversations, friends, groups enz. geïntroduceerd waar ik nog niet de hele reikwijdte van doorgrond. Conversaties zijn de commentaren die op een bericht kunnen worden gegeven. Die kun je toevoegen aan je coComments (dat heet “tracken”),  maar in Internet Explorer gaat het de ene keer wel, de andere keer verschijnt niet de mogelijkheid om de conversatie te tracken. In Mozilla Firefox gaat het beter, maar ook niet altijd. Sommige conversaties bij Laika kan ik tracken, hoewel ik er helemaal niet aan heb deelgenomen, maar de conversatie over de iPod op mijn eigen blog geeft een lege commentaarlijst, terwijl er wel degelijk commentaar is. Bovendien had ik gedacht hele blogs te kunnen toevoegen, maar je kunt je alleen op een conversatie abonneren, niet op het blog als geheel. In Mozilla is de installatie van de bookmarklet ook mislukt: de knop toont de uitgeschreven javascript functie. Niet erg fraai.

Cocomment button FirefoxOmdat ik niet weet hoe je een feed kunt invoeren lijkt dit me niet bruikbaar om alle reakties op de spoetnik sites te tracken. Het merkwaardige is ook dat je coComments-bladzijde in Technorati moet claimen om je Technorati blog te synchroniseren. Ik vind mijn coCommentspagina geen blog, maar ja we doen het maar. Daarom hieronder weer zo’n link naar het Technorati-profiel in de hoop dat dit het gewenste resultaat oplevert: dat het commentaar op mijn blog zichtbaar wordt als coComment.

Technorati Profile

(Ik heb het verkeerd begrepen, de bovenstaande code had ik bij coComment in mijn account moeten plakken. Afijn, bij Technorati heb ik nu twee blogs, maar bij coComments nog niks. En gesynchroniseerd is er ook niks. Ik begrijp het niet.) 

Verder ben ik begonnen met de opzet van een Wiki. Dat wil ik eens uitproberen omdat we voor het onderwijs altijd op zoek zijn naar een handige manier om opdrachten, lesprogramma’s, presentaties en ander materiaal te bewaren. Zodanig dat het ook later gebruikt kan worden en dat er interactief aan gewerkt kan worden. We hebben wel een website, maar die is nogal lastig in de bediening en niet interactief. Een database zou ook kunnen, maar zo’n Wiki is min of meer een kant en klaar pakket. Dus dat lijkt me wel handig. Hiermee loop ik dus iets op de cursus vooruit, maar de toepaasing is nu al bruikbaar. Ik heb gekozen voor Tikiwiki. Blijkt een grote installatie te zijn van 45 Mb, wat fors is voor een webserver. Ben onder de indruk van de mogelijkheden. Het aanmaken en linken van bladzijden gaat heel anders dan bij “gewone” html. Heb al wel ontdekt dat het een goede methode is om de uba-feeds mee weer te geven.

Enige dagen heeft een enigszins complete feed van de commentaren in een groot aantal spoetnik blogs op de website gestaan, maar dat blijkt wel een erg grote inbreuk op de privacy.  Ik heb hem daarom nu weer weg gehaald en vervangen door een ingang naar de Wiki. De rss-feed is hier beschikbaar voor als je hem in je iReader wilt plakken, of bekijk de lijst. Hij is niet compleet, want de blogspot blogs en een aantal blogs die foutmeldingen gaven (misschien omdat ze nog geen commentaar verzameld hebben?) heb ik er af gehaald. Ze zijn makkelijk weer toe te voegen door achter het wordpressadres /comment/feed te plakken.

Verder ziet het er naar uit dat ik binnenkort weer moet upgraden, want WordPress heeft versie 2.5 uitgebracht en nu verschijnt bovenaan mijn blog in de dashboard de volgende mededeling:

Upgrade

Brughagedis op Technorati

25 March, 2008 (22:34) | Blog's, Brughagedis | By: brughagedis

Om vat te krijgen op de informatiestroom die dagelijks in Spoetnik wordt geproduceerd heb ik voor mezelf twee kanalen gecreëerd: de feeds en de iframes van de blogs. Maar als je op wereldschaal wilt volgen wat er allemaal gebeurt kun je bij Technorati terecht. Een concurrent is Google Blogsearch.

Technorati is een in 2002 opgerichte zoekmachine gespecialiseerd in blogs en enorm omvangrijk. Er worden meer dan 112  miljoen blogs geïndexeerd  en nog eens twee keer zoveel “getagde sociale media”, sites met foto’s, video’s, podcasts e.d. Volgens eigen cijfers ontstaan er wereldwijd elke dag meer dan 175.000 nieuwe blogs en worden dagelijks meer dan 1.6 miljoen berichten geplaats. 

TitelBalk

Vanaf de openingspagina zijn er portals naar een aantal hoofdonderwerpen, zoals geld, cultuur, lifestyle, sport, politiek en technologie. Daarnaast is er een Blog Directory met een onderwerpsindeling bestaande uit folders. De navigatie is erg op content gericht. Als je je blog zoekt krijg je slechts een lijstje met verschenen berichten. Het heeft mij even gekost voor ik erachter kwam dat ik moest inloggen om bij de gegevens van mijn blog te komen. 

Ik had me eigenlijk bij Technorati aangemeld omdat ik zag dat Laika mij als favoriet had opgenomen in haar profiel. Dat wilde ik graag beantwoorden. In mijn achterhoofd speelde ook mee dat ubabert zich afvroeg of hij zijn blog bij Technorati moest claimen n.a.v. één van de befaande tips van WoW!ter. Dat gaf de doorslag en ik heb me om twaalf uur ‘s nachts aangemeld. Wel lastig dat je dan nog even je site in het Engels moet beschrijven, maar het is gelukt.

Icoontjes Door je blog te  claimen, zeg je zoveel als dat het van jouw is. Om dat te controleren worden  twee methodes gehanteerd: of je geeft je inlognaam en wachtwoord van je blog éénmalig af, of je zet een voorgstructureerde link naar je profiel op je blog. Ik koos voor de laatste methode. De Spiders van Technorati herkennen je dan als eigenaar. Vanaf dat moment wordt je blog geïndexeerd. Bij WordPress blogs wordt er automatisch een ping naar Technorati gestuurd als je een nieuw bericht hebt geplaatst. Bij andere systemen (Blogspot) moet je dat zelf aan Technorati laten weten. Het bericht verschijnt dan in het lijstje met berichten van je eigen blog. Ook zie je de reakites op je berichten op andere blogs. Zo kun je je eigen blog volgen en dat van je favorieten. Je blog krijgt op Technorati een zgn. Authority (Autoriteitsgetal) wat afhankelijk is van het aantal links dat ernaar verwijst. Daarbij tellen links uit verschillende websites zwaarder dan links uit een beperkt aantal andere websites. Ook krijg je een ranking die de afstand tot de top weergeeft. Hoe hoger de ranking des groter die afstand. Topblogs hebben een authoriteitsgetal van 20.000 tot 23.000 en duizenden fans. Wat ik erg leuk vindt zijn de kleine thumbnailtjes van je blog. Die zouden ze ook voor spoetnikblogs moeten maken.

Vanavond zag ik een actueel bericht: De brughagedis (Tuatara) is de snelst evoluerende diersoort op aarde! Maar dat wist ik natuurlijk al lang!

Snelst evoluerende diersoort op Aarde

Technorati claim

18 March, 2008 (22:54) | Blog's, Brughagedis | By: brughagedis

Encyclopedia of Life

4 March, 2008 (11:24) | Brughagedis | By: brughagedis

Dit is een ontzettend leuke en nuttige website met als doel om informatie te verzamelen over alle soorten levende wezens in de hele wereld. Nog niet alle soorten zijn beschreven, zo is de pagina over brughagedissen (Tuatara sphenodon) nog erg leeg…

EOL-Tuatara sphenodon

Handig is dat de meest voorkomende namen in allerlei talen worden vermeld. Daarmee is de Grzimeck’s Het leven der dieren definitief verleden tijd.

Drakenseks

23 February, 2008 (11:47) | Brughagedis | By: brughagedis

Wij leven al 220 miljoen jaar onveranderd op ons eilandje in de Stille Zuidzee. Er is wel verschil tussen mannetjes en vrouwtjes, de mannetjes zijn wat groter en steviger waardoor ze op de vrouwtjes een Bokito-achtige aantrekkingskracht hebben. De grootste en sterkste mannetjes paren met de meeste vrouwtjes. Tijdens de paring houdt het mannetje het vrouwtjes bij de keel vast en geen enkel vrouwtje dat zich daar later over zal beklagen. Wij zouden wel gek zijn om ons orgaan in de bek van het vrouwtje te stoppen, want de kans is groot dat ze het abusievelijk voor een vette worm aanziet en afbijt.

De mannetjes en de vrouwtjes zijn gelijker dan bij jullie, want net als in het feministisch ideaal van de jaren tachtig, hebben wij allemaal een dubbel X-chromosoom. Een apart Y-chromosoom voor mannentjes is er niet. Bij ons is het heel normaal dat mannetjes vrouwtjes worden en andersom. Afhankelijk van de temperatuur in het nest waarin de eieren gedurende 10 maanden liggen te bakken worden bij hogere temperaturen het geslacht bepaald in een mannetje en bij lagere in een vrouwtje. Door het broeikasteffect ontstaat er nu het gevaar van een overschot aan mannetjes. Bij onze verwanten de Komodovaranen is paring niet eens noodzakelijk, en kan voortplanting plaatsvinden zonder bevruchting, de z.g. parthenogenese of maagdelijke geboorte.

Baby Brughagedis, net uit ei

Baby brughagedis, net uit het ei. 
Bron:
whakatikei river forest restoration project

Aangezien de Neocortex bij ons nog niet zo ontwikkeld is, laten wij ons primair leiden door het limbische systeem dat de lagere instincten regelt. Bij jullie lijkt wat dat betreft een omgekeerde trend zichtbaar. We zullen vanavond dan ook aandachtig kijken naar de aangekondigde film. Drakenseks is niet helemaal onschuldig want volgens de  Urban Dictionary betekent  het seks met een vrouw met een soa waardoor een branderig of geïrriteerd gevoel ontstaat.
Naschrift: Ongeveer net zoiets als kijken naar die film gisteravond… Na 20 minuten afgehaakt.



View Stats